次世代シーケンサの課題と解決方法
次世代シーケンサのデータ解析でお困りのお客様へ
大学、研究所等で次世代シークエンサーを共同利用機器として運用するデータ解析環境には、さまざまな課題があります。
弊社は、各研究者の研究目的達成にむけて、上記のような課題やお悩みに対するソリューションをご提供いたします。
ソリューションの内容
導入時支援
- データ解析に必要なソフトウェアをまとめてセットアップします。
・フリーソフトウェアのインストール(詳細はこちら)
・弊社独自の3次解析システムを含む解析パイプライン構築(詳細はこちら)
※導入前にディスカッションをおこない、必要なアプリケーション/インストールソフトウェアをご提案致します。
- ハードウェア(データ解析システムのハードウェア構成やデータのバックアップ環境など)のご提案
- データ解析に必要な共同利用サーバ運用のご提案
運用時支援
- データ解析の相談窓口設置
電話、E-Mail、Skype等で研究内容を伺い、解析用サーバにセットアップされているソフトウェアの使用方法、カスタマイズの必要性、新たなソフトウェアのインストールなどアドバイスをいたします。(必要に応じてお見積をいたします)
- 共同利用解析サーバの運用支援業務(※1)
利用環境の補助業務をおこないます。
・ユーザ毎にデータ解析環境をセットアップ
・解析に必要な公共遺伝子データベースをダウンロード
・アプリケーション実行のための初期設定 - 解析ソフトウェアのオペレーション代行(※1)
- サーバ監視業務(※1)
・ハードディスクの利用状況のチェック
・システムのログを確認し、サーバやOSに異常がないかチェック
※1は、弊社よりインターネット経由で解析サーバにリモートアクセスできる環境が必要です。
研究目的に応じて解析システムのバージョンアップ
- 解析ソフトウェアのカスタマイズ
ご依頼の内容に従って、解析システムのバージョンアップやプログラム拡張のご提案とお見積を行います。
- 解析パイプラインの追加
・フリーソフトウェアのインストール
・解析パイプラインの追加
・3次解析アプリケーション用のスクリーニングシステム(メイズ社製)の追加
ご提案の流れ
導入実績
- 某国立大学解析センター様
ソリューションの一覧
ソリューション | コスト | ||
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導入時支援 | データ解析に必要な解析ソフトウェアをまとめてセットアップします。 ※ 導入前に、ディスカッションをおこない対応アプリケーションとインストールソフトを決定します。 |
フリーソフトウェアのインストール (詳細はこちら) |
初期導入費用 |
弊社独自のシステムを含む、3次解析を行う解析パイプライン構築 (詳細はこちら) |
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ハードウェアのご提案 | データ解析システムのハードウェア構成やデータのバックアップ環境など | ||
データ解析に必要な共同利用サーバ運用のご提案 | |||
運用時支援 | データ解析の相談窓口設置 | 電話、E-Mail、Skype等で研究内容を伺い、解析用サーバにセットアップされているソフトウェアの使用方法、カスタマイズの必要性、新たなソフトウェアのインストールなどアドバイスいたします。必要に応じてお見積をいたします。 | 年間費用 |
共同利用解析サーバの運用支援業務(※1) | 利用環境の補助業務をおこないます。 ・ユーザ毎にデータ解析環境をセットアップ ・解析に必要な公共データベースをダウンロード ・アプリケーション実行のための初期設定 |
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解析ソフトウェアのオペレーション代行(※1) | |||
サーバ監視業務(※1) | ・ハードディスクの利用状況のチェック ・システムのログを確認し、サーバやOSに異常がないかチェック |
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研究目的に応じて 解析システムの バージョンアップ |
解析ソフトウェアのカスタマイズ | ご依頼の内容に従って、解析システムのバージョンアップやプログラム拡張のご提案とお見積を行います。 | 初期導入費用 |
解析パイプラインの追加 ※ 運用ルールによりますが、共同利用サーバの場合、ソフトウェアのインストールは、何らかの管理下で行われるのをお勧めします。 |
・フリーソフトウェアのインストール ・解析パイプラインの追加 ・3次解析アプリケーション用のスクリーニングシステム(メイズ社製)の追加 |
※1は、インターネット経由で解析サーバにリモートアクセスできる環境が必須です。